MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome II

Total Repeats: 5915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004343	TGAA	2	8	12	19	50 %	25 %	25 %	0 %	24217062
2	NC_004343	AAATC	2	10	67	76	60 %	20 %	0 %	20 %	24217062
3	NC_004343	TCAA	2	8	184	191	50 %	25 %	0 %	25 %	24217062
4	NC_004343	TTCA	2	8	199	206	25 %	50 %	0 %	25 %	24217062
5	NC_004343	T	7	7	224	230	0 %	100 %	0 %	0 %	24217062
6	NC_004343	A	6	6	316	321	100 %	0 %	0 %	0 %	24217062
7	NC_004343	TC	3	6	414	419	0 %	50 %	0 %	50 %	24217062
8	NC_004343	TGGT	2	8	524	531	0 %	50 %	50 %	0 %	24217062
9	NC_004343	GAA	2	6	558	563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217062
10	NC_004343	CCT	2	6	611	616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24217062
11	NC_004343	T	7	7	638	644	0 %	100 %	0 %	0 %	24217062
12	NC_004343	TTA	2	6	662	667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24217062
13	NC_004343	GAT	2	6	675	680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217062
14	NC_004343	ATT	2	6	695	700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24217062
15	NC_004343	GAA	2	6	702	707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217062
16	NC_004343	ACGT	2	8	763	770	25 %	25 %	25 %	25 %	24217062
17	NC_004343	AGTT	2	8	778	785	25 %	50 %	25 %	0 %	24217062
18	NC_004343	AGAAA	2	10	799	808	80 %	0 %	20 %	0 %	24217062
19	NC_004343	ACAA	2	8	876	883	75 %	0 %	0 %	25 %	24217062
20	NC_004343	GGTCT	2	10	922	931	0 %	40 %	40 %	20 %	24217062
21	NC_004343	TGC	2	6	968	973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24217062
22	NC_004343	TCAA	2	8	977	984	50 %	25 %	0 %	25 %	24217062
23	NC_004343	CGGAGA	2	12	1040	1051	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	24217062
24	NC_004343	AAG	2	6	1057	1062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217062
25	NC_004343	ATG	2	6	1177	1182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217062
26	NC_004343	ACG	2	6	1273	1278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24217062
27	NC_004343	A	6	6	1302	1307	100 %	0 %	0 %	0 %	24217062
28	NC_004343	GAT	2	6	1368	1373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217062
29	NC_004343	ACT	2	6	1392	1397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24217062
30	NC_004343	A	6	6	1424	1429	100 %	0 %	0 %	0 %	24217062
31	NC_004343	GAA	2	6	1434	1439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217062
32	NC_004343	AAG	2	6	1537	1542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217062
33	NC_004343	GTT	2	6	1644	1649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24217062
34	NC_004343	GAC	2	6	1656	1661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24217062
35	NC_004343	TCC	3	9	1793	1801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24217062
36	NC_004343	GAA	2	6	1825	1830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217062
37	NC_004343	GAG	2	6	1912	1917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24217062
38	NC_004343	TTC	3	9	1919	1927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217062
39	NC_004343	TGG	2	6	1976	1981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24217062
40	NC_004343	CTT	2	6	2035	2040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217062
41	NC_004343	A	6	6	2120	2125	100 %	0 %	0 %	0 %	24217062
42	NC_004343	T	6	6	2145	2150	0 %	100 %	0 %	0 %	24217062
43	NC_004343	CGG	2	6	2269	2274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24217062
44	NC_004343	CTT	2	6	2299	2304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217062
45	NC_004343	CGG	2	6	2434	2439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24217062
46	NC_004343	TTC	2	6	2512	2517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217062
47	NC_004343	AAT	2	6	2527	2532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24217062
48	NC_004343	TCC	2	6	2604	2609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294653594
49	NC_004343	ATT	2	6	2753	2758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294653594
50	NC_004343	ATC	2	6	2835	2840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294653594
51	NC_004343	AGGAGA	2	12	2883	2894	50 %	0 %	50 %	0 %	294653594
52	NC_004343	A	6	6	2899	2904	100 %	0 %	0 %	0 %	294653594
53	NC_004343	GGT	2	6	2980	2985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294653594
54	NC_004343	AGA	2	6	3021	3026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653594
55	NC_004343	GACT	2	8	3063	3070	25 %	25 %	25 %	25 %	294653594
56	NC_004343	T	8	8	3086	3093	0 %	100 %	0 %	0 %	294653594
57	NC_004343	TTAG	2	8	3124	3131	25 %	50 %	25 %	0 %	294653594
58	NC_004343	CTT	2	6	3179	3184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653594
59	NC_004343	TC	3	6	3235	3240	0 %	50 %	0 %	50 %	294653594
60	NC_004343	AAG	2	6	3254	3259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653594
61	NC_004343	GAA	2	6	3274	3279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653594
62	NC_004343	AGA	2	6	3286	3291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653594
63	NC_004343	AG	3	6	3319	3324	50 %	0 %	50 %	0 %	294653594
64	NC_004343	TCAA	2	8	3365	3372	50 %	25 %	0 %	25 %	294653594
65	NC_004343	TTCTTT	2	12	4075	4086	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	24217066
66	NC_004343	GGT	2	6	4091	4096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24217066
67	NC_004343	A	6	6	4097	4102	100 %	0 %	0 %	0 %	24217066
68	NC_004343	GTAT	2	8	4239	4246	25 %	50 %	25 %	0 %	24217066
69	NC_004343	TCT	2	6	4256	4261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217066
70	NC_004343	TTCC	2	8	4312	4319	0 %	50 %	0 %	50 %	24217066
71	NC_004343	TC	3	6	4332	4337	0 %	50 %	0 %	50 %	24217066
72	NC_004343	TGT	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24217066
73	NC_004343	TTC	2	6	4381	4386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217066
74	NC_004343	CCA	2	6	4387	4392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24217066
75	NC_004343	TTC	2	6	4444	4449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217066
76	NC_004343	AAG	2	6	4486	4491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217066
77	NC_004343	GAACCG	2	12	4512	4523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24217066
78	NC_004343	AGA	3	9	4553	4561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217066
79	NC_004343	T	7	7	4593	4599	0 %	100 %	0 %	0 %	24217066
80	NC_004343	T	9	9	4617	4625	0 %	100 %	0 %	0 %	24217066
81	NC_004343	T	6	6	4627	4632	0 %	100 %	0 %	0 %	24217066
82	NC_004343	GAAA	2	8	4720	4727	75 %	0 %	25 %	0 %	24217066
83	NC_004343	GCT	2	6	4757	4762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24217066
84	NC_004343	CGT	2	6	4779	4784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24217066
85	NC_004343	TTC	2	6	4789	4794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217066
86	NC_004343	TGT	2	6	4825	4830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24217066
87	NC_004343	GGT	2	6	4833	4838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24217066
88	NC_004343	TCT	2	6	5329	5334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653593
89	NC_004343	A	6	6	5373	5378	100 %	0 %	0 %	0 %	294653593
90	NC_004343	CAA	2	6	5460	5465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294653593
91	NC_004343	AGAA	2	8	5496	5503	75 %	0 %	25 %	0 %	294653593
92	NC_004343	TTC	2	6	5543	5548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653593
93	NC_004343	CCT	2	6	5572	5577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294653593
94	NC_004343	GAA	2	6	5599	5604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653593
95	NC_004343	ATT	2	6	5654	5659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294653593
96	NC_004343	T	6	6	5697	5702	0 %	100 %	0 %	0 %	294653593
97	NC_004343	A	6	6	5717	5722	100 %	0 %	0 %	0 %	294653593
98	NC_004343	TTTC	2	8	5737	5744	0 %	75 %	0 %	25 %	294653593
99	NC_004343	A	6	6	5752	5757	100 %	0 %	0 %	0 %	294653593
100	NC_004343	TC	3	6	5788	5793	0 %	50 %	0 %	50 %	294653593
101	NC_004343	ATC	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294653593
102	NC_004343	TTTC	2	8	5899	5906	0 %	75 %	0 %	25 %	294653593
103	NC_004343	TGGA	2	8	5918	5925	25 %	25 %	50 %	0 %	294653593
104	NC_004343	TTC	2	6	5972	5977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653593
105	NC_004343	GAA	2	6	6058	6063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653593
106	NC_004343	T	6	6	6104	6109	0 %	100 %	0 %	0 %	294653593
107	NC_004343	GTTTT	2	10	6590	6599	0 %	80 %	20 %	0 %	24217071
108	NC_004343	CTC	2	6	6684	6689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24217071
109	NC_004343	TC	3	6	6724	6729	0 %	50 %	0 %	50 %	24217071
110	NC_004343	GGA	2	6	6790	6795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24217071
111	NC_004343	AAAT	2	8	6801	6808	75 %	25 %	0 %	0 %	24217071
112	NC_004343	CTT	2	6	6895	6900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217071
113	NC_004343	TA	3	6	7027	7032	50 %	50 %	0 %	0 %	24217071
114	NC_004343	GTA	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217071
115	NC_004343	A	7	7	7085	7091	100 %	0 %	0 %	0 %	24217071
116	NC_004343	AT	4	8	7110	7117	50 %	50 %	0 %	0 %	24217071
117	NC_004343	GAA	2	6	7153	7158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217071
118	NC_004343	AG	3	6	7216	7221	50 %	0 %	50 %	0 %	24217071
119	NC_004343	GAA	2	6	7252	7257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217071
120	NC_004343	A	9	9	7340	7348	100 %	0 %	0 %	0 %	294653592
121	NC_004343	T	7	7	7372	7378	0 %	100 %	0 %	0 %	294653592
122	NC_004343	CTC	2	6	7411	7416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294653592
123	NC_004343	A	8	8	7474	7481	100 %	0 %	0 %	0 %	294653592
124	NC_004343	TCAT	2	8	7492	7499	25 %	50 %	0 %	25 %	294653592
125	NC_004343	TAC	2	6	7535	7540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294653592
126	NC_004343	TTC	2	6	7579	7584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653592
127	NC_004343	A	6	6	7590	7595	100 %	0 %	0 %	0 %	294653592
128	NC_004343	CTT	2	6	7639	7644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653592
129	NC_004343	GAGAA	2	10	7649	7658	60 %	0 %	40 %	0 %	294653592
130	NC_004343	TTC	2	6	7709	7714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653592
131	NC_004343	T	7	7	7720	7726	0 %	100 %	0 %	0 %	294653592
132	NC_004343	T	6	6	7833	7838	0 %	100 %	0 %	0 %	294653592
133	NC_004343	CTTT	2	8	7920	7927	0 %	75 %	0 %	25 %	294653592
134	NC_004343	TGC	2	6	7958	7963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294653592
135	NC_004343	GTT	2	6	8025	8030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294653592
136	NC_004343	AGA	3	9	8039	8047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653592
137	NC_004343	GGT	2	6	8073	8078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294653592
138	NC_004343	TTC	2	6	8104	8109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653592
139	NC_004343	CAAA	2	8	8252	8259	75 %	0 %	0 %	25 %	294653592
140	NC_004343	A	6	6	8257	8262	100 %	0 %	0 %	0 %	294653592
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146	NC_004343	TTAC	2	8	8746	8753	25 %	50 %	0 %	25 %	294653592
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174	NC_004343	G	7	7	9944	9950	0 %	0 %	100 %	0 %	24217074
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183	NC_004343	CT	3	6	10298	10303	0 %	50 %	0 %	50 %	24217074
184	NC_004343	TCT	3	9	10338	10346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217074
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264	NC_004343	TCTAT	2	10	14011	14020	20 %	60 %	0 %	20 %	24217078
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268	NC_004343	GAA	2	6	14118	14123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217078
269	NC_004343	A	8	8	14151	14158	100 %	0 %	0 %	0 %	24217078
270	NC_004343	GA	3	6	14332	14337	50 %	0 %	50 %	0 %	24217078
271	NC_004343	CAAAA	2	10	14402	14411	80 %	0 %	0 %	20 %	24217078
272	NC_004343	A	8	8	14436	14443	100 %	0 %	0 %	0 %	24217078
273	NC_004343	A	6	6	14661	14666	100 %	0 %	0 %	0 %	24217078
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401	NC_004343	TGTCC	2	10	21281	21290	0 %	40 %	20 %	40 %	24217086
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405	NC_004343	A	7	7	21410	21416	100 %	0 %	0 %	0 %	24217086
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